Przy okazji dostosowywania swoich motocykli do obowiązującej normy EURO 4 KTM przedstawił odświeżoną i ulepszoną wersję modelu RC390.
Główną zmianą jest oczywiście zmniejszony poziom emisji szkodliwych substancji do atmosfery. Austriacy osiągnęli cel przeprojektowując układ wydechowy - został on poprowadzony po prawej stronie motocykla, co pozwoliło na uzyskanie większego prześwitu. Zmieniony został także tłumik, a motocykl zyskał sterowany elektronicznie zawór przepustnicy(ride-by-wire).
To nie koniec zmian - RC390 na 2016 rok wyposażony został w sprzęgło poślizgowe(antyhoppingowe), które zapobiega wpadaniu w poślizg tylnego koła w czasie ostrej redukcji biegów na torze. Zmienione zostały także podnóżki pasażera. Motocykl zyskał także większą tarcze hamulcową - zamiast 300 mm mamy teraz tarczę 320mm. Inne zmiany to regulowana dźwignia sprzęgła i hamulca, nowe lusterka, przeprojektowany zbiornik paliwa i wyższe o 12 mm siedzenie pasażera. Waga motocykla pozostała bez zmian - 147 kg na sucho.